Các Phân hệ chính của phần mềm bao gồm:

1. Phân hệ quản lý Dược; 2. Phân hệ quản lý kho thuốc Ngoại trú; 3. Phân hệ quản lý kho thuốc Nội trú; 4. Phân hệ quản lý kho thuốc Dịch vụ; 5. Phân hệ quản lý kho thuốc Đông y; 6. Phân hệ quản lý kho thuốc Hóa chất, sinh phẩm; 7. Phân hệ quản lý kho thuốc Vật tư; 8. Phân hệ quản lý Bộ phận tiếp đón; 9. Phân hệ quản lý Phòng khám; 10. Phân hệ quản lý các Khoa CLS; 11. Phân hệ quản lý các Khoa lâm sàng; 12. Phân hệ quản lý Bảo hiểm y tế; 13. Phân hệ quản lý Thuế; 14. Phân hệ quản lý Lương; 15. Phân hệ quản lý Tài chính kế toán; 16. Phân hệ Báo cáo & thống kê; 17. Phân hệ Quản trị hệ thống; 18. Đào tạo và chuyển giao công nghệ; 19. Bảo hành & bảo trì hệ thống;