Các Phân hệ chính của phần mềm bao gồm:

1.      Phân hệ quản lý Dược; 2.      Phân hệ quản lý kho thuốc BHYT; 3.      Phân hệ quản lý kho thuốc Nội trú; 4.      Phân hệ quản lý kho thuốc Đông y; 5.      Phân hệ quản lý tiếp đón; 6.      Phân hệ quản lý Phòng khám; 7.      Phân hệ quản lý các Khoa lâm sàng; 8.      Phân hệ quản lý Bảo hiểm y tế; 9.      Phân hệ quản lý Tài chính kế toán; 10.  Phân hệ Báo cáo & thống kê; 11.  Phân hệ Quản trị hệ thống; 12.  Đào tạo và chuyển giao công nghệ; 13.  Bảo hành & bảo trị toàn hệ thống;